Foot-and-mouth disease viruses are often restricted to specific geographical regions and spread to new areas may lead to significant epidemics. Phylogenetic analysis of sequences of the VP1 genome region of recent outbreak viruses from Libya and Saudi Arabia has revealed a lineage, O-Ind-2001, normally found in the Indian subcontinent. This paper describes the characterization of field viruses collected from these cases and provides information about a new real-time RT-PCR assay that can be used to detect viruses from this lineage and discriminate them from other endemic FMD viruses that are co-circulating in North Africa and western Eurasia.
Ibrahim Eldaghayes(12-2014)

يحتوي جنس بكتريا الضمة على عدة أنواع من السلالات الغذائية الممرضة والتي تسبب عدة أعراض سريرية مختلفة منها التسمم الدموي او انتان دموي septicemia والكوليراcholera والتهابات بسيطة للمعدة والأمعاء gastroenteritis. والعديد من سلالة الضمات مرتبط انتقالها بالغذاء مثال: ضمة كوليرا او الضمة الهيضيةVibrio cholerae ضمة باراهيمولاتكس Vibrio parahemolyticus, وضمة فالنفيكيس Vibrio vulnificus المسببة لإسهال بسيط مقارنة بالتي تحدثه الكوليرا. إجمالي عدد93 عينة من مأكولات بحرية واللحوم الحيوانية ومنتجاتها. والتي تشمل عدد 46 عينة من مأكولات بحرية (21 جمبريshrimps و 5 بلبوشclam و 8 سردينsardine و1 شولا amberjack و1 كلب بحرshark و 2 فروج dusky grouper و 2 صبارصannular sea bream و1 ابرة البحرsea needle و1 دندنشي commen dentex و4 كواليmackerel ) وعدد 34 عينة لحوم خام (9 لحم إبل، 10 لحم بقر، 6 لحم ضأن و 9 لحم دجاج). واشتملت الدراسة ايضا على عدد 13 عينة من المنتجات الحيوانية (2 نقانق لحم بقر، 5 شرائح برجر لحم بقر، 5 شرائح برجر لحم دجاج و عينة واحدة كباب)، تم جمعها من مناطق جغرافية مختلفة بليبيا وهي ( طرابلس، رقدا لين، جنزور، وطبرق شملتها هذه الدراسة). كل العينات المذكورة تعرضت للتحليل الميكروبي لتحديد العدد البكتيري الوسطيmean bacterial count لمستعمرات الضمات بأجراء عزل سلالة الضمات بالزرع التقليدي conventional culturalوكذلك إجراء اختبار البلمرة والتسلسل الجينيPCR and sequencing of 16SrDNA للعينات الموجبة. أظهرت النتائج أن عدد 48 عينة من أصل 93 عينة بنسبة (51.6%) والتي تم زرعتها علي وسط TCBS) thiosulfate-citrate-bile salts-sucrose agar) اظهرت مستعمرات بكتيرية يعتقد انها لسلالة الضمات. كذلك أن 27 عينة من أصل 46 عينه من مأكولات بحرية بنسبة (58.7%), أظهرت مستعمرات بكتيرية يعتقد انها لسلالة الضمات علي وسط TCBS. بينما قد وجد 21 عينة فقط من اصل 47عينة بنسبة ((44.6%من اللحوم ومنتجاتها اظهرت مستعمرات بكتيرية يعتقد انها لسلالة الضمات علي وسط .TCBS من خلال زرع عينات مأكولات بحرية, وجد أعلى نسبة من العدد البكتيري الوسطيmean bacterial count كانت في البلبوشclam بنسبة 3.8x 104 CFU/g)) وقيمة انحراف معياري standard deviation value كان (2.3x104 CFU/g). ومن جهة اخري عينات برجر لحم دجاج اظهرت اعلي نسبة من العدد البكتيري الوسطي كانت (6.5x104 CFU/g) وقيمة انحراف معياري standard deviation valueكان (1.7x104 CFU/g). هذا وأظهرت البلمرة والتسلسل الجيني ان 11عينة من أصل 48 بنسبة (22.9%) كانت من سلالة الضمات المختلفة، كما تم عزل ضمة باراهيمولاتيكس Vibrio parahemolyticus من لحم الإبل ويعد هذا أول مرة تعزل في ليبيا. من جهة اخري وجد ان 28 عينة والتي (يعتقد انها من سلالة الضمات) من اصل 48 بنسبة (58.33%) التي تم فحصها باختبار البلمرة والتسلسل الجيني اظهرت عديد من الميكروبات المختلفة. مع العلم ان هناك 9 عينات والتي( يعتقد انها من سلالة الضمات) من اصل 48 بنسبة (18.75%) كانتoverlapped peaks قمة التداخل وغير مفضلة في اختبار البلمرة والتسلسل الجيني. بالإضافة فقد وجد ان اكثر البكتيري شيوعا بالفحص هي : Proteus spp., Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, and Enterobacter spp. هذه النتائج ربما ترجع الي العديد من العوامل مثل التلوث البيئي اثناء اعدادها وتخزينها ونقلها وبيعها. و باختصار تعتبر هذه الدراسة خطوة مستقبلية أولية في ليبيا للاتجاه بخطى حثيثة باستخدام اختبار البلمرة والتسلسل الجيني في مأكولات بحرية واللحوم ومنتجاتها.
عماد الدين الهادي الفلاني (2015)

A potential pathological role for spirochaetes in bovine digital dermatitis (bovine DD) and severe virulent ovine foot rot (SVOFR) has been considered and a treponeme isolate obtained from each disease in the UK. In this work, we have investigated the hypothesis that the two diseases may have a shared (common) spirochaetal aetiology. Experiments were designed to identify serological similarities and differences between the two spirochaetes; an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was developed to detect anti-treponeme antibodies in the sera of cows and sheep against the two-treponeme isolates. Sera were further tested for antigen reactivity by Western blotting. Cattle and sheep with bovine DD and SVOFR, respectively, had increased seropositivity rates to both treponeme isolates, with different patterns of reactivity between farms. In some cattle herds, significant correlations were shown between antibodies to bovine DD treponemes and SVOFR treponemes (P0.05); sheep showed strong evidence of reactivity to one or the other treponeme antigens, but never to both. Western blotting against both treponeme antigens showed that they frequently displayed different antigen epitopes, although some minor bands were common to both organisms. The data suggest that there are a number of spirochaetes in UK farms, which could be involved in the pathogenesis of either bovine DD or SVOFR. arabic 13 English 83
Abdulgader Dhawi Alfitouri Dhawi(1-2021)