Abstract This study was conducted to evaluate in vitro and in vivo antagonistic activities of five Trichoderma isolates; three local (Lib1, Lib2, Lib3) and two commercial (T22, Tp1) against mycelium radial growth and sclerotia formation of the plant pathogenic fungus Sclerotinia sclerotiorum, and its effect on seed germination and infection of pea (Pisum sativum L.) seeds. All experiments were conducted at two growth temperatures, 20 and 25˚C. Microscopic interactions of Trichoderma isolates and host fungus were performed by slide culture technique. Two concentrations (10, 20%) of Trichoderma culture filtrate were tested for their effect on mycelium growth. All Trichoderma isolates were able to inhibit the growth of the fungal pathogen, although, variations were observed among tested isolates in rate and mechanisms of inhibition. At 25⁰C Lib2 showed the highest rate of mycelium growth and spore formation. In mycoparasitism, the inhibition rate was 55% for Lib3 and 45% for Lib1. Whereas for indirect interactions; significant inhibition of mycelium radial growth was observed for Lib1 and Tp1 with a percentage of 28.5 and 26.4 respectively. Overgrowth was also reported on the colonies of S. sclerotiorum by Lib2 and T22, and these two isolates showed remarkable inhibition of sclerotia formation with a percentage rate of 91. The effect of culture filtrate of Trichoderma isolates was dose dependent, 20% concentration of culture filtrate lowered the rate of radial growth of S. sclerotiorum by 53% for Lib1 and 47.2% for Tp1, while lower inhibition of Sclerotinia radial growth was reported for 10% concentration of culture filtrate with a percentage of 45 for Lib1 and 34 for Tp1. At 20⁰C 10% and 20% culture filtrate exhibited lower effect on mycelium radial growth of Sclerotinia. Seed germination of peas (local variety) was enhanced by Trichoderma treatment. Increased rate of seed germination was reported by 96.6% for Lib1, Lib2 and 80% for Lib3 and 76% for Tp1, lower inhibitory effect was reported for T22 by 43%. Seed treated with Trichoderma isolates exhibited low rate of seedlings infection by S. sclerotiorum.
عواطف علي شليبيك (2013)

"يسبب مرض اللفحة المبكرة early blight أضراراً كبيرة للمجموع الخضري على نباتات العائلة الباذنجانية ومنها الطماطم. جُمعت خمسة عشرة عزلة (12 عزلة من الطماطم، عزلتان من البطاطس عزلة واحدة من الفلفل) لفطر A. solani من مصادر مختلفة بطرابلس. أُجريت بعض الدراسات الحقلية والمعملية لتحديد الاختلافات بين تلك العزلات، وذلك من حيث السلوك المزرعي على الوسط الغذائي PDA، الخصائص الظاهرية، القدرة الإمراضية والاختلافات الجزيئية. أظهرت مستعمرات العزلات المختبرة اختلافاً فيما بينها عند إستنباتها على الوسط الغذائي PDA يتراوح بين النمو القطني الى المسطح وبلون زيتوني الى زيتوني غامق. أنتجت العزلات صبغات غيرت من لون الوسط الغذائي الذي تراوح بين اللون الرمادي والبني. بينت دراسة الخصائص الظاهرية للفطر تكون حوامل كونيدية قصيرة تحمل جراثيم كونيدية تختلف في عددها من عزلة إلى أُخرى فهي إما جرثومة كونيدية مفردة أو على هيئة سلاسل من جرثومتين؛ كما أوضحت الدراسة وجود فروقات معنوية في حجم كونيديا عزلات الفطر، تتراوح أبعادها من 23.45 الى 46.90 × 7.70 الى 14.00 ميكرومتر. أظهرت العزلات تبايناً كبيراً عند اختبار قدرتها الإمراضية على ثمار، نباتات وأوراق طماطم منفصلة، تراوحت بين شديدة، متوسطة الى ضعيفة الإمراضية. إن دراسة التنوع الوراثي لعزلات فطر A. solani باستخدام RAPD-PCR وبادئات عشوائية قصيرة، قد أظهر اختلافات معنوية تمثلت في وجود أنماط مختلفة من حزم DNA متعددة وأُحادية المظهر. استطاعت ثلاث بادئات من أصل عشرة (OPA-07، OPA-09، OPJ-09) تحديد البصمة الوراثية للعزلات الخمسة عشر، وقد أظهر التحليل العنقودي لنواتج RAPD-PCR أن البادئ OPA-07 تمكن من تصنيف العزلات إلى خمس مجموعات: مجموعة A (TF4، TF7، TL1، TL3)، مجموعة B (TF1، TF3، TF8، PEF) مجموعة C (TF5، TF6، TF9، POL1، POL2)، في حين ان العزلتين المتبقيتين TL2 و TF2 ذات نمط تحزيمي فريد أُطلق عليهما المجموعة U1 و U2 على التوالي. أما البادئ OPA-09 فقد وضع العزلات في أربعة مجاميع وهي: مجموعة A (TF4، TF6، TF7، TF8، TL2)، مجموعة B (POL1، TL3، TF3)، مجموعة C (TF5، POL2) ومجموعة D (TL1، TF1، TF2 TF9، PEF). في حين ان البادئ OPJ-09 قد أستطاع تصنيف تلك العزلات الى أربعة مجاميع وراثية محددة هي: مجموعة A (TF1، TF7، TL3، PEF)، مجموعة B (TF3، TF8، POL2) مجموعة C (TF2، TF6، TF9، TL2) ومجموعة D (TF4، TF5). لقد برهنت نتائج RAPD-PCR على وجود اختلافات جزيئية جديرة بالإهتمام بين عزلات A. solani أمكن من خلالها تصنيف تلك العزلات ضمن مجموعات مختلفة وأنماط فريدة، دون وجود علاقة تربط بين مجاميع الأنماط العنقودية وكل من العائل النباتي، الخصائص الظاهرية والقدرة الإمراضية لتلك العزلات. Abstract Early blight disease causes severe damage to the foliar part of solanaceous crops including tomato. Fifteen isolates (12 from tomato, 2 from potato, 1 from pepper) were collected from different sources in Tripoli. Field and laboratory studies were conducted to determine cultural behaviour on PDA medium, morphological, pathogenic and molecular variation between isolates tested. Colonies of isolates revealed variation in their cultural behaviour on PDA medium ranging from cottony to appressed growth, with colour ranging between light to dark olivaceous. The pigments released by the isolates changed the medium colour to grey or brown. Morphological studies of the fungal isolates exhibited short conidiophores bearing a single or chains of paired conidia. This study revealed a significant variation in conidial size for the isolates tested ranging from 23.45 to 46.90 x 7.70 to 14.00 µm. Pathogenicity testes on fruits, plants, and detached leaves of tomato indicated a high significant variation between isolates tested ranging from highly to moderate or weak pathogenic. Genetic diversity of A. solani isolates using RAPD-PCR with oligonuclotide primers revealed significant differences in the appearance of polymorphic and monomorphic banding patterns. Three primers (OPA-07, OPA-09, OPJ-09) out of ten were able to determine the genetic fingerprints of tested isolates. Cluster analysis of RAPD-PCR products showed that primer OPA-07 was able to classify the isolates into five groups: group A (TF4,TF7, TL1, TL3), group B (TF1,TF3, TF8, PEF), group C (TF5, TF6, TF9, POL1, POL2), whereas the remaining two isolates TL2 and TF2 were unique in their patterns and were designated as group U1 and U2 respectively. Primer OPA-09 revealed four distinct genetic groups designated as: group A (TF4, TF6, TF7, TF8, TL2), group B (POL1, TL3, TF3), group C (TF5, POL2) and group D (TL1, TF1, TF2, TF9, PEF). However primer OPJ-09 was able to split the isolates tested into four distinct clusters: group A (TF1, TF7, TL3, PEF), group B (TF3, TF8, POL2), group C (TF2, TF6, TF9, TL2) and group D (TF4, TF5). The results of RAPD-PCR demonstrate existence of considerable variation in molecular characteristics of A. solani isolates. Accordingly these isolates were classified into different groups and unique patterns with no obvious association between the pattern of clustering of the isolates and their host of origin, morphological characteristics and pathogenicity"
هاجر محمد الصويد (2014)

تعتبر الاشيريكية القولونية من أكثر الممرضات البكتيرية تقلباً. سلالات من هذه البكتيريا تمتلك عوامل شراسة تمكنها من التسبب في حدوث الإمراض الاسهالية وكذلك الإصابات خارج الجهاز المعوي، عن طريق العديد من الميكانيكيات الامراضية الخاصة.الاشيريكية القولونية الممرضة معوياً Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) هي من أهم مجموعات الاشيريكية القولونية المسهلة والمرتبطة مع إسهال الأطفال الرضع في الدول النامية. كذلك تكمن أهمية الاشيريكية القولونية المدمية معوياً Enterohemorrhagic EHEC)) Escherichia coli في الإصابات الآدمية، في ارتباط هذه الكائنات مع نوعين من الأمراض المهمة وهي التهابات القولون المدمي وحالات البول المدمي. الهدف من هذه الدراسة هو مدى وجود سلالات الاشيريكية القولونية التابعة لمجموعتي EPECو EHEC في الأطفال وفي مصادر الأغذية والمياه في منطقة طرابلس-الجماهيرية. لاشيريكية القولونية عزلت من المصادر المختلفة شملت براز الأطفال والأغذية والمياه. أجريت الاختبارات الميكروبيولوجية لجميع العزولات واستعمل نظام API20E للتأكد من تعريف العزولات. الاختبارات المصلية عن طريق التراص على الشريحة أشارت إلى أن 132 عزولة كانت تنتمي إلي السلالات التابعة إلي مجموعتي EPEC وEHEC، وقورنت النتائج مع دراسات أخرى. تم عزل المجموعات المصلية التالية والتي تتبع EPEC وEHEC O26:، O45، O55، O86، O103 ، O111 ، O114،O119 ،O121، O125، O126، O127، O128، O142 ، O145 ، O175،O158 . نتائج اختبارات مدى حساسية العزولات للمضادات الحيوية كانت متنوعة ,وجميع العزولات كانت حساسة للمضاد الحيوي amikacin . Abstract Escherichia coli is probably the most versatile of all bacterial pathogens .Strains of this species posses combination of virulence factors that enable them to cause diarrheal diseases and also the cause of extra intestinal diseases by means of several distinct pathogenic mechanisms .Enteropathogenic Escherichia coli ( EPEC) is an important categories of diarrheagenic E.coli which has been linked with infant diarrhea in developing world .The importance of Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) in human diseases lies in the association between these organisms and two diseases, hemorrhagic colitis (HC) and hemolytic uremic syndrome (HUS) . The aim of this study was to detect the presence of EPEC and EHEC in children and in foods and water sources in Tripoli –Jamahiriya.E.coli was isolated from all sources. Full microbiological studies were performed on all isolates, and API20E system was used to confirm their identification .Serological studies by slide agglutination showed 132 isolates were belong to EPEC and EHEC serogroups .The following serogroups were isolated : O26,O45,O86,O55, O103,O111,O114,O119,O121,O125,O126, O127,O128,O142,O145, O157 and O158The results were compared with those of other investigators.Results of antibiotics sensitivity were variable and all of isolates were sensitive for one antibiotic amikacin .
ربيعة عبد الحفيظ عبد القادرالكوت (2008)